Православный Шаргородский монастырь был основан, как униатский в 1719 году напротив костела, через центральную дорогу. Около 1782 года новый владелец Шаргорода Иосиф Сосновский предоставил базилианам для продолжения сооружения монастыря и школы-бурсы развалины замка и необходимые средства. Школа, в которой иногда обучалось до шестисот учащихся, славилась на всем Правобережье.
В центре бывшего монастырского подворья, занявшего верхнее плато междуречья, высится видимый со всех мест Шаргорода огромный собор св. Николая Мирликийского. Здание с четырехколонным портиком на главном фасаде, который обращен, вопреки канону, на юг, а не на запад, были заложены еще при базилианах, что успели поднять стены только до первых окон. Завершено же строительство было только в 1806-1818 годах, уже в православии.
Монументальность собора резко контрастировала с мирской суетой шаргородских обывателей, однако в каменной стене с башнями по углам и трехъярусной колокольней в центре, против главного фасада собора, возведенными в 1848 году, размещались лавки торговцев, которые зримо сочетавшие святость обители с суетой мира сего. До восточного крыла собора примыкает двухэтажный корпус келий. Поперек торца келий - длинное здание бурсы. Архитектура его проста, утилитарная и не лишена некоторой утонченности. Примечательно, что такие же портики из спаренных колонн, и при входе в собор, устроены и в здании бурсы и на втором этаже корпуса келий, только пропорционально уменьшены. После присоединения края к России монастырь был освящен в православный, а школа - в семинарию, позднее - в духовное училище.
В XX в. при установлении советской власти в Шаргороде, как и по всей Украине, было преследование христиан, а особенно католиков. Новая власть пыталась прекратить культовую деятельность Католической церкви, но благодаря крепкой вере местных католиков сделать этого не удалось. К сожалению, к монастырю судьба не была благосклонна, как к костелу. В 1937 году монастырь был закрыт. В послевоенные годы, с 1946 по 1963 годы, в его стенах был размещен сельскохозяйственный техникум. Затем, после закрытия техникума, были годы забвения, когда древние стены стояли пустыми и только местные мальчишки нарушали покой величественного сооружения. В начале 80-х годов прошлого века в помещении монастыря был размещен городской музей изобразительного искусства. Тогда на монументальных колоннах вместо старинных икон разместили портреты передовиков социалистического труда. Лишь в 1986 году была возобновлена ??работа монастыря. Сейчас это действующий Свято-Николаевский Шаргородский мужской монастырь. Несколько лет назад при монастыре была создана школа звонарей. Ученики школы своим мастерством прославились далеко за рамки не только города, области, но и на просторах Украины.